Logiciels
Dans cette section, vous trouverez des liens vers des logiciels développés par des membres du GGMM.
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ANTHEPROT 3D
Logiciel d’analyse et de visualisation de protéine ou d’acide nucléique.
Auteurs : G. Deléage et C. Geourjon
Laboratoire : Institut de Biologie et Chimie des Protéines (PBIL – IBCP) CNRS UPR 412
LIEN
GENMOL
Logiciel de modélisation moléculaire pour la génération, l’optimisation et l’analyse de molécules et de systèmes moléculaires.
Auteurs : G. Pepe et D. Siri
Laboratoire : Centre interdisciplinaire de nanoscience de Marseille (CINAM) CNRS UPR 3118
LIEN
GENO3D
Serveur Web de modélisation moléculaire de protéines
Auteurs : C. Combet, M. Jambon, G. Deleage et C. Geourjon
Laboratoire : Institut de Biologie et Chimie des Protéines (PBIL – IBCP) CNRS UPR 412
LIEN
NPS@
Serveur Web d’analyse de séquence de protéines (BLAST, FASTA, SSEARCH, ClustalW, Multalin, Prédiction de structure secondaire, Pattinprot, etc).
Auteurs : C. Combet, C. Blanchet, C. Geourjon et G. Deleage
Laboratoire : Institut de Biologie et Chimie des Protéines (PBIL – IBCP) CNRS UPR 412
SUMO
Serveur Web de comparaison de structure 3D de protéines au niveau des sites “fonctionnels”.
Auteurs : M. Jambon, G. Deleage et C. Geourjon
Laboratoire : Institut de Biologie et Chimie des Protéines (PBIL – IBCP) CNRS UPR 412
HYPERBALLS
Visualisation innovante de molecules sur carte graphique. Representations boules-et-batonnets, licorice, van der Waals, surface et HyperBall.
Auteurs: M. Chavent, A. Vanel, A. Tek, B. Levy, S. Robert, B. Raffin et M. Baaden
Laboratoire: Laboratoire de Biochimie Théorique (LBT) CNRS UPR 9080
MDDRIVER
Librairie pour le couplage de codes de simulation et de visualisation pour effectuer des simulations interactives.
Auteurs: O. Delalande, N. Férey, G. Grasseau et M. Baaden
Laboratoire: Laboratoire de Biochimie Théorique (LBT) CNRS UPR 9080
